Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 4933428C19Rik-201ENSMUST00000146043 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 Gm14437-201ENSMUST00000152284 360 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 1700049E15Rik-202ENSMUST00000152737 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 Flt3l-210ENSMUST00000211246 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 Platr25-206ENSMUST00000222303 1171 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 AC165260.2-202ENSMUST00000224998 631 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 Apoc3-201ENSMUST00000034586 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PcntP48725 Hba-a1-201ENSMUST00000093209 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 Gm9583-201ENSMUST00000219613 1843 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PcntP48725 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PcntP48725 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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PcntP48725 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PcntP48725 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcntP48725 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PcntP48725 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PcntP48725 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PcntP48725 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PcntP48725 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PcntP48725 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PcntP48725 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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PcntP48725 Sectm1a-202ENSMUST00000100126 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcntP48725 Gm6880-201ENSMUST00000114125 627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PcntP48725 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcntP48725 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcntP48725 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcntP48725 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcntP48725 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PcntP48725 Plekha5-206ENSMUST00000203774 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcntP48725 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcntP48725 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcntP48725 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcntP48725 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcntP48725 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcntP48725 Gm6225-201ENSMUST00000181558 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcntP48725 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcntP48725 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PcntP48725 Lrrc8dos-201ENSMUST00000135958 586 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms