Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
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