Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Nccrp1G3X9C2 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Nccrp1G3X9C2 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nccrp1G3X9C2 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms