Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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