Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prrt4B2RU40 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prrt4B2RU40 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms