Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms