Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3238W4VSP7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3238W4VSP7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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