Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5114W4VSN8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5114W4VSN8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5114W4VSN8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5114W4VSN8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm5114W4VSN8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm5114W4VSN8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm5114W4VSN8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5114W4VSN8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms