Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac6Q9Z2V5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hdac6Q9Z2V5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac6Q9Z2V5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
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