Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T6

Krt85, Keratin, type II cuticular Hb5, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt85Q9Z2T6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt85Q9Z2T6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt85Q9Z2T6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt85Q9Z2T6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt85Q9Z2T6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt85Q9Z2T6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt85Q9Z2T6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt85Q9Z2T6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt85Q9Z2T6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt85Q9Z2T6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt85Q9Z2T6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Krt85Q9Z2T6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt85Q9Z2T6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 545.9 ms