Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc23a1Q9Z2J0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc23a1Q9Z2J0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc23a1Q9Z2J0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc23a1Q9Z2J0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc23a1Q9Z2J0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc23a1Q9Z2J0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc23a1Q9Z2J0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc23a1Q9Z2J0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc23a1Q9Z2J0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc23a1Q9Z2J0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc23a1Q9Z2J0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms