Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mbd1Q9Z2E2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd1Q9Z2E2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms