Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdpk1Q9Z2A0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdpk1Q9Z2A0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdpk1Q9Z2A0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdpk1Q9Z2A0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdpk1Q9Z2A0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdpk1Q9Z2A0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdpk1Q9Z2A0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdpk1Q9Z2A0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdpk1Q9Z2A0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdpk1Q9Z2A0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdpk1Q9Z2A0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdpk1Q9Z2A0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdpk1Q9Z2A0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdpk1Q9Z2A0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdpk1Q9Z2A0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdpk1Q9Z2A0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdpk1Q9Z2A0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdpk1Q9Z2A0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdpk1Q9Z2A0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms