Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trip6Q9Z1Y4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trip6Q9Z1Y4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms