Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs4Q9Z1T2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Thbs4Q9Z1T2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Thbs4Q9Z1T2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Thbs4Q9Z1T2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms