Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp4Q9Z1N6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms