Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rspo1Q9Z132 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rspo1Q9Z132 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms