Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmg20bQ9Z104 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmg20bQ9Z104 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms