Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pmfbp1Q9WVQ0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms