Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp46a1Q9WVK8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp46a1Q9WVK8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms