Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU62

Incenp, Inner centromere protein, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IncenpQ9WU62 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IncenpQ9WU62 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IncenpQ9WU62 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IncenpQ9WU62 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms