Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scnn1bQ9WU38 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Scnn1bQ9WU38 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Scnn1bQ9WU38 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Scnn1bQ9WU38 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms