Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp18Q9WTV6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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