Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Abcc6Q9R1S7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Abcc6Q9R1S7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Abcc6Q9R1S7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms