Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc26a4Q9R155 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc26a4Q9R155 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc26a4Q9R155 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms