Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htra1Q9R118 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms