Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NrkQ9R0G8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NrkQ9R0G8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NrkQ9R0G8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NrkQ9R0G8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms