Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zeb2Q9R0G7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zeb2Q9R0G7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zeb2Q9R0G7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms