Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vav3Q9R0C8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vav3Q9R0C8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms