Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Lamc3Q9R0B6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Lamc3Q9R0B6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Lamc3Q9R0B6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms