Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prkab1Q9R078 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prkab1Q9R078 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms