Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh2d3cQ9QZS8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh2d3cQ9QZS8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms