Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col4a3Q9QZS0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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