Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp21Q9QZL6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp21Q9QZL6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp21Q9QZL6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp21Q9QZL6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp21Q9QZL6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp21Q9QZL6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp21Q9QZL6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp21Q9QZL6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp21Q9QZL6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp21Q9QZL6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms