Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ripk3Q9QZL0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ripk3Q9QZL0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms