Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ercc4Q9QZD4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ercc4Q9QZD4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms