Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphp1Q9QY53 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphp1Q9QY53 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms