Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdzd4Q9QY39 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd4Q9QY39 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms