Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp3Q9QY23 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 934 ms