Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxe3Q9QY14 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxe3Q9QY14 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms