Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc5Q9QX29 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpc5Q9QX29 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpc5Q9QX29 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms