Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chaf1aQ9QWF0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chaf1aQ9QWF0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chaf1aQ9QWF0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms