Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc4Q9QUQ5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc4Q9QUQ5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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