Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tlr4Q9QUK6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tlr4Q9QUK6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms