Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdgfl3Q9JMG7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms