Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Reep6Q9JM62 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Reep6Q9JM62 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms