Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rabgef1Q9JM13 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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