Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms