Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtsmQ9JL96 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtsmQ9JL96 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsmQ9JL96 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms