Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bace2Q9JL18 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bace2Q9JL18 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms